药学学报

Pathway	Count	Gene
Salmonella infection	6	MAPK1, IL6, JUN, IL1B, MAPK8, NOS2
VEGF signaling pathway	5	MAPK1, PTGS2, VEGFA, SRC, KDR
Focal adhesion	7	MAPK1, JUN, VEGFA, MET, MAPK8, SRC, KDR
Influenza A	6	MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8, PLG
GnRH signaling pathway	5	MAPK1, JUN, MAPK8, MMP2, SRC
Toll-like receptor signaling pathway	5	MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8
NOD-like receptor signaling pathway	4	MAPK1, IL6, IL-1β, MAPK8
MAPK signaling pathway	6	MAPK1, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8, FGF2
ErbB signaling pathway	4	MAPK1, JUN, MAPK8, SRC
Herpes simplex infection	5	IL6, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8
Cytokine-cytokine receptor interaction	5	IL6, VEGFA, MET, IL-1β, KDR
Arginine and proline metabolism	3	NOS1, ALDH2, NOS2
Regulation of actin cytoskeleton	5	MAPK1, INS, ITGB2, FGF2, SRC
Cell adhesion molecules (CAMs)	4	SELP, ITGB2, SELE
FoxO signaling pathway	4	MAPK1, IL6, INS, MAPK8
Glycerolipid metabolism	3	LPL, AKR1B1, ALDH2
Adherens junction	3	MAPK1, MET, SRC
Progesterone-mediated oocyte maturation	3	MAPK1, INS, MAPK8

Pathway

Count

Gene

Salmonella infection

MAPK1, IL6, JUN, IL1B, MAPK8, NOS2

VEGF signaling pathway

MAPK1, PTGS2, VEGFA, SRC, KDR

Focal adhesion

MAPK1, JUN, VEGFA, MET, MAPK8, SRC, KDR

Influenza A

MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8, PLG

GnRH signaling pathway

MAPK1, JUN, MAPK8, MMP2, SRC

Toll-like receptor signaling pathway

MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8

NOD-like receptor signaling pathway

MAPK1, IL6, IL-1β, MAPK8

MAPK signaling pathway

MAPK1, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8, FGF2

ErbB signaling pathway

MAPK1, JUN, MAPK8, SRC

Herpes simplex infection

IL6, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8

Cytokine-cytokine receptor interaction

IL6, VEGFA, MET, IL-1β, KDR

Arginine and proline metabolism

NOS1, ALDH2, NOS2

Regulation of actin cytoskeleton

MAPK1, INS, ITGB2, FGF2, SRC

Cell adhesion molecules (CAMs)

SELP, ITGB2, SELE

FoxO signaling pathway

MAPK1, IL6, INS, MAPK8

Glycerolipid metabolism

LPL, AKR1B1, ALDH2

Adherens junction

MAPK1, MET, SRC

Progesterone-mediated oocyte maturation

MAPK1, INS, MAPK8

Pathway	Count	Gene
Salmonella infection	6	MAPK1, IL6, JUN, IL1B, MAPK8, NOS2
VEGF signaling pathway	5	MAPK1, PTGS2, VEGFA, SRC, KDR
Focal adhesion	7	MAPK1, JUN, VEGFA, MET, MAPK8, SRC, KDR
Influenza A	6	MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8, PLG
GnRH signaling pathway	5	MAPK1, JUN, MAPK8, MMP2, SRC
Toll-like receptor signaling pathway	5	MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8
NOD-like receptor signaling pathway	4	MAPK1, IL6, IL-1β, MAPK8
MAPK signaling pathway	6	MAPK1, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8, FGF2
ErbB signaling pathway	4	MAPK1, JUN, MAPK8, SRC
Herpes simplex infection	5	IL6, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8
Cytokine-cytokine receptor interaction	5	IL6, VEGFA, MET, IL-1β, KDR
Arginine and proline metabolism	3	NOS1, ALDH2, NOS2
Regulation of actin cytoskeleton	5	MAPK1, INS, ITGB2, FGF2, SRC
Cell adhesion molecules (CAMs)	4	SELP, ITGB2, SELE
FoxO signaling pathway	4	MAPK1, IL6, INS, MAPK8
Glycerolipid metabolism	3	LPL, AKR1B1, ALDH2
Adherens junction	3	MAPK1, MET, SRC
Progesterone-mediated oocyte maturation	3	MAPK1, INS, MAPK8

Pathway

Count

Gene

Salmonella infection

MAPK1, IL6, JUN, IL1B, MAPK8, NOS2

VEGF signaling pathway

MAPK1, PTGS2, VEGFA, SRC, KDR

Focal adhesion

MAPK1, JUN, VEGFA, MET, MAPK8, SRC, KDR

Influenza A

MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8, PLG

GnRH signaling pathway

MAPK1, JUN, MAPK8, MMP2, SRC

Toll-like receptor signaling pathway

MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8

NOD-like receptor signaling pathway

MAPK1, IL6, IL-1β, MAPK8

MAPK signaling pathway

MAPK1, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8, FGF2

ErbB signaling pathway

MAPK1, JUN, MAPK8, SRC

Herpes simplex infection

IL6, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8

Cytokine-cytokine receptor interaction

IL6, VEGFA, MET, IL-1β, KDR

Arginine and proline metabolism

NOS1, ALDH2, NOS2

Regulation of actin cytoskeleton

MAPK1, INS, ITGB2, FGF2, SRC

Cell adhesion molecules (CAMs)

SELP, ITGB2, SELE

FoxO signaling pathway

MAPK1, IL6, INS, MAPK8

Glycerolipid metabolism

LPL, AKR1B1, ALDH2

Adherens junction

MAPK1, MET, SRC

Progesterone-mediated oocyte maturation

MAPK1, INS, MAPK8

Ligand	COX-2	VEGFR2
The control ligand of COX-2 (tolfenamic acid)	1.504	-
The control ligand of VEGFR2 (C₁₄H₂₃N₅O)	-	3.244
Luteolin (6)	6.765	6.638
Apigenin (8)	6.793	-
Quercetin (98)	6.679	6.374
Kaempferol (422)	6.533	6.256
Ursolic acid (511)	-	7.458

Ligand

COX-2

VEGFR2

The control ligand of COX-2 (tolfenamic acid)

1.504

The control ligand of VEGFR2 (C₁₄H₂₃N₅O)

3.244

Luteolin (6)

6.765

6.638

Apigenin (8)

6.793

Quercetin (98)

6.679

6.374

Kaempferol (422)

6.533

6.256

Ursolic acid (511)

7.458

Ligand	COX-2	VEGFR2
The control ligand of COX-2 (tolfenamic acid)	1.504	-
The control ligand of VEGFR2 (C₁₄H₂₃N₅O)	-	3.244
Luteolin (6)	6.765	6.638
Apigenin (8)	6.793	-
Quercetin (98)	6.679	6.374
Kaempferol (422)	6.533	6.256
Ursolic acid (511)	-	7.458

Ligand

COX-2

VEGFR2

The control ligand of COX-2 (tolfenamic acid)

1.504

The control ligand of VEGFR2 (C₁₄H₂₃N₅O)

3.244

Luteolin (6)

6.765

6.638

Apigenin (8)

6.793

Quercetin (98)

6.679

6.374

Kaempferol (422)

6.533

6.256

Ursolic acid (511)

7.458

基于网络药理学的复方血栓通治疗糖尿病视网膜病的药理机制研究

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宋勇丽 ¹ , 王政霖 ¹ , 邢玮 ¹ , 吴晏 ² , 王伟 ¹ , 韩静 ²^,^*

药学学报 | 专题报道 2018,53(9): 1442-1448

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药学学报 | 专题报道 2018, 53(9): 1442-1448

基于网络药理学的复方血栓通治疗糖尿病视网膜病的药理机制研究

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宋勇丽¹, 王政霖¹, 邢玮¹, 吴晏², 王伟¹, 韩静²^,^*

作者信息

1.北京中医药大学中医学院, 北京 100029

2.北京中医药大学北京中医药研究院, 北京 100029

通讯作者:

* 韩静, Tel:86-10-64286404, E-mail:hanjing8585@163.com

Pharmacological mechanism of Compound Xueshuantong in treatment of diabetic retinopathy based on network pharmacology

Yong-li SONG¹, Zheng-lin WANG¹, Wei XING¹, Yan WU², Wei WANG¹, Jing HAN²^,^*

Affiliations

1. School of Traditional Chinese Medicine, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 100029, China

2. Institute of Traditional Chinese Medicine, Beijing University of Chinese Medicine, Beijing 100029, China

出版时间: 2018-09-15 doi: 10.16438/j.0513-4870.2018-0270

文章导航

摘要

收起

利用网络药理学发现复方血栓通治疗糖尿病视网膜病的药理机制。采用TCMSP软件检索复方血栓通的活性成分，并且得到其活性成分对应的靶点；然后通过OMIM、TTD、pharmGkb、DiGSeE和GAD 5个数据库检索糖尿病视网膜病相关靶点；两者取交集得到37个相同的靶点。用SystemsDock在线分子对接工具验证结果。使用DAVID软件对37个靶点进行GO注释分析和KEGG通路分析。采用Cytoscape 3.6.1软件建立活性成分-靶点-通路网络模型。网络药理学研究提示，复方血栓通可能通过血管内皮生长因子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路和Toll样受体信号通路等多个通路治疗糖尿病视网膜病，体现了中药复方多成分、多靶点、多通路的特点。此研究为进一步阐释复方血栓通治疗糖尿病视网膜病的药理机制提供了理论依据。

关键词

网络药理学 / 复方血栓通 / 糖尿病视网膜病 / 靶点

Abstract

收起

The aim of this study was to discover the pharmacological mechanism of Compound Xueshuantong in the treatment of diabetic retinopathy using network pharmacology. TCMSP software was used to search the active ingredients of Compound Xueshuantong, and the targets of its active ingredients were obtained. The targets of diabetic retinopathy were searched by OMIM, TTD, pharmGkb, DiGSeE and GAD database. The same 37 targets were analyzed by GO and KEGG using DAVID software. The results were verified using the SystemsDock. Cytoscape 3.6.1 software was used to establish an ingredient-target-pathway network model. Network pharmacological studies suggest that Compound Xueshuantong treated diabetic retinopathy through the vascular endothelial growth factor signaling pathways, mitogen-activated protein kinase signaling pathways and Toll-like receptor signaling pathways. Compound Xueshuantong alleviated diabetic retinopathy through multi-component, multi-target, and multi-pathway. This study provides a theoretical basis for further elucidation of the pharmacological mechanism of Compound Xueshuantong in the treatment of diabetic retinopathy.

Key words

network pharmacology / Compound Xueshuantong / diabetic retinopathy / target

引用本文

宋勇丽, 王政霖, 邢玮, 吴晏, 王伟, 韩静. 基于网络药理学的复方血栓通治疗糖尿病视网膜病的药理机制研究. 药学学报, 2018 , 53 (9) : 1442 -1448 . DOI: 10.16438/j.0513-4870.2018-0270

Yong-li SONG, Zheng-lin WANG, Wei XING, Yan WU, Wei WANG, Jing HAN. Pharmacological mechanism of Compound Xueshuantong in treatment of diabetic retinopathy based on network pharmacology[J]. Acta Pharmaceutica Sinica, 2018 , 53 (9) : 1442 -1448 . DOI: 10.16438/j.0513-4870.2018-0270

正文

收起

糖尿病视网膜病(diabetic retinopathy, DR), 是糖尿病患者在后期最严重的微血管并发症, 也是工作人群失明的首要原因^[1]。中医药在治疗DR方面的优势不断凸显, 已成为防治DR的重要组成部分^[2]。复方血栓通作为国家二级中药保护品种, 是眼底病用药的第一品牌。它是由三七、黄芪、丹参和玄参组成的中药复方, 功能为活血化瘀、益气养阴, 具有扩张血管、增加血流量、改善血液循环和微循环的药理作用, 能有效减轻黄斑水肿, 改善视力^[3]。复方血栓通的药理学机制包括扩张血管、提高抗缺氧能力、抑制氧化应激、减少凋亡、抑制血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)表达、调控Hippo信号通路等^[4]。但是DR发病机制复杂, 因此复方血栓通的药理机制仍未完全阐明。

网络药理学是在高通量组学数据分析、计算机虚拟计算及网络数据库检索基础上, 从分子生物网络角度, 系统地揭示药物药理作用及其作用机制^[5]。中药复方多成分、多靶点、多途径的特征正是网络药理学研究的重点^[6]。

Cheng等^[7]利用网络药理学的思路与方法, 建立了“药物-靶点-通路-网络”的研究模式, 预测清肺消炎丸的潜在靶标及作用途径, 初步揭示了其抗炎作用的多维调控网络。Liu等^[8]首先收集了四君子汤的化学成分信息, 构建化合物-靶点和靶点-疾病网络, 然后采用网络药理学方法预测了四君子汤潜在的作用靶点与可能作用的疾病。但是在上述利用网络药理学研究中药复方药理机制的范例中, 靶点是由化学成分推导而来, 并没有考虑到靶点是否与特定疾病的核心发病机制密切相关, 这样将导致药物靶点广泛并且复杂。本文拟把中药复方的成分靶点与疾病靶点取交集进行分析, 这样取得的结果将对疾病更加有针对性, 更加明确可靠。

材料与方法

收起

化学成分信息 从TCMSP (http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)中分别检索三七、黄芪、丹参和玄参的化学成分, 收集化学成分-靶点信息。

DR相关靶点的获得 从OMIM (http://www.omim.org/)、TTD (http://systemsdock.unit.Oist.jp/iddp/home/index)、pharmGkb (https://www.pharmgkb.org/)、DiGSeE (http://210.107.182.61/geneSearch/)、GAD (http://geneticassociationdb.nih.gov/) 5个疾病相关靶点的数据库检索DR相关靶点, DiGSe (http://210.107. 182.61/geneSearch)为在线文本挖掘工具, 可以挖掘疾病相关基因。

靶点名称矫正 利用Uniprot (http://www.uniprot.org/)数据库, 输入从TCMSP和5个数据库得到的靶点名称, 得到对应的基因名称, 对蛋白质名称进行矫正。优先选择Swiss-prot收录并且匹配程度高的基因名称。将复方血栓通和DR矫正后的基因取交集。

靶点通路注释分析 利用DAVID (http://david.nifcrf.gov/)数据库对得到的交集基因进行GO注释分析(Gene-Ontology)和KEGG通路分析(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)。交集基因可以直接映射到通路上。

化学成分-交集基因-通路网络构建 根据上述复方血栓通化学成分的靶点预测结果, 采用Cytoscape 3.6.1软件构建化学成分-交集靶点-通路网络模型。网络中, 节点(node)表示化学成分、交集基因和通路。若某一靶点为某化合物的潜在作用靶点, 则以边(edge)相连, 该靶点参与某一通路时, 将靶点与作用通路也以边相连。通过构建网络揭示复方血栓通治疗DR多成分、多靶点、多通路的特点^[9]。

分子对接 利用UniProt检索, 选择合适的目标靶点的PDB ID, 利用RSCB PBD (http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do)下载对接蛋白和对照配体的3D结构文件, 对照配体由RSCB PBD系统自动匹配。利用PubChem下载化合物的3D结构文件。使用SystemsDock在线分子对接工具进行在线分子对接。

结果

收起

1 化学成分和靶点基因的收集

检索得到复方血栓通中三七的化学成分有119种, 丹参202种, 黄芪87种, 玄参47种。删除重复项共427种化学成分, 包括黄酮、萜类、苷类、糖类、脂肪酸和氨基酸等化合物, 如木犀草素(luteolin)、芹菜素(apigenin)、丹参酮ⅡA (dehydrotanshinone Ⅱ A)、丹酚酸B (salvianolic acid b)、熊果酸(ursolic acid)、L-赖氨酸(L-lysin) (编号分别为6、8、2651、7074、511、55)等。Sun等^[10]通过UPLC-MS/MS法对复方血栓通胶囊中的主要化学成分进行了含量测定, 发现其中丹参酮ⅡA、丹酚酸B和熊果酸等的含量分别为1.135、2.343和0.560 mg·g^-1。复方血栓通的化学成分对应376个基因, 例如VEGF、丝裂原活化蛋白激酶8 (mitogen-activated protein kinase 8, MAPK8)、白细胞介素-1β (interleukin 1β, IL-1β)等(图 1)。

2 相关靶点通路信息

从5个数据库得到DR相关基因共247个, 包括血管内皮生长因子A (vascular endothelial growth factor A, VEGFA)、MAPK1、MAPK8等, DAVID分析得到有Toll样受体信号通路(Toll-like receptor signaling pathway, TLR)、MAPK受体信号通路(MAPK signaling pathway)、VEGF信号通路(VEGF signaling pathway)等通路信息(表 1)。

3 交集基因的生物分子功能注释

将复方血栓通靶点基因和DR的相关基因取交集, 共有37个相同基因, 包括VEGF、基质金属蛋白酶(matrix metalloproteinases, MMP)、IL-1β、PTGS2 (别名环氧酶-2, cyclooxygenase 2, COX-2)和MAPK8等。

将37个交集基因通过DAVID系统进行生物分子功能注释。对获取靶点信息进行GO注释分析和KEGG通路分析。其中GO注释分析分为三部分, 分别为生物过程分子功能(molecular function, MF)、细胞组分(cellular component, CC)和生物过程(biological process, BP) (图 2~4)。

交集基因在分子功能中对蛋白结合(protein binding)和肝素结合(heparin binding)功能参与最多, 相关基因包括转录因子AP-1 (transcription factor AP-1, JUN)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶(proto- oncogene tyrosin e-protein kinase Src, SRC)、VEGFA等(图 2)。

交集基因在细胞外间隙(extracellular space)、细胞溶质(cytosol)、细胞表面(cell surface) 3个部位分布最多。超氧化物歧化酶[Cu-Zn] (superoxide dismutase [Cu-Zn], SOD1)、IL-6和IL-1β等基因参与其中(图 3)。

交集基因参与炎症应答、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、内皮细胞增殖的正调控作用等生物过程最多。一氧化氮合酶1 (nitric-oxide synthase 1, NOS1)、IL-6、IL-1β和VEGFA等基因参与其中(图 4)。

4 化学成分-交集基因-通路网络的构建

由KEGG分析, 共得到18条通路, 包括24个交集基因, 以P≤0.05为标准筛选通路, 最终得到14条通路(FoxO信号通路、甘油脂代谢、黏附连接和孕酮介导的卵母细胞成熟, P > 0.05剔除)及22个基因(LPL和AKR1B1剔除)。

采用Cytoscape软件构建化学成分-基因-通路网络模型(图 5)。共169个节点, 458个边。作用于MAPK8、IL-6、IL-1β、COX-2的有效化学成分较多, 这些靶点涉及较多的通路有TLR信号通路、MAPK信号通路和VEGF信号通路。作用于上述靶点和通路的化学成分有木犀草素、芹菜素、熊果酸、L-赖氨酸等。复方血栓通主要活性成分的作用靶点分布在不同的信号通路上, 相互协调, 共同发挥作用。并且文献^[4]报道复方血栓通治疗DR的机制主要有扩张血管、提高抗缺氧能力、抑制氧化应激、减少凋亡、抑制VEGF等, 也与本文网络预测结果符合。本研究可以从多角度揭示复方血栓通治疗DR的药理机制。

5 分子对接

选择COX-2和VEGFR2两个靶点, 木犀草素、芹菜素、槲皮素、山奈酚和熊果酸(编号6、8、98、422、511) 5个化合物及4个靶点的对照配体进行分子对接(表 2)。

分子对接的结果与本文利用网络药理学预测的结果一致, 编号6、8、98、422、511这5个化合物的对接打分均明显高于对照配体, 说明5个化合物与COX-2和VEGFR2作用良好。

讨论

收起

复方血栓通治疗DR已经在临床上得到证实^[4]。但是目前对复方血栓通治疗DR的药理机制尚不明确。2008年, Hopkins^[11]明确提出“网络药理学”的概念, 本文利用网络药理学的研究思路, 探讨了复方血栓通治疗DR潜在的作用靶点和机制, 预测复方血栓通治疗DR的可能作用靶点和通路。

炎症反应是视网膜血管被高糖刺激后出现的初始反应, 表现为白细胞聚集, 炎症因子分泌大量增加; 新生血管形成则是DR的标志性病理特征。本文在对DR相关性基因进行分析后发现, 在炎症反应及血管增生过程中, VEGF信号通路^[12]、TLR信号通路^[13]及MAPK信号通路^[14]扮演了核心角色, 涉及到MAPK1、COX-2、VEGFA、IL-1β、IL-6和成纤维细胞生长因子2 (fibroblast growth factor 2, FGF2)等基因。COX-2是炎症过程中的一个重要的诱导酶, COX-2促血管生成可能与其诱导组织生成VEGF有关, VEGF特异性地直接作用于内皮细胞表面受体, 促进血管生成^[15]。VEGF-A是VEGF家族的重要成员, 可促进新生血管形成和血管通透性增加。

VEGF信号通路、TLR通路和MAPK通路三者相互协调, 相互影响。例如, COX-2与TLRs均能通过诱导组织生成VEGFA, 后者与其受体KDR结合后, 激活MAPK1/8或c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase, JNK)等, 从而影响MAPK信号通路; MAPK是FGF2诱导血管生成的调节因子^[16], FGF2对内皮细胞有趋化和促进有丝分裂作用, 促进血管形成, 导致血管增生的发生。同时, Seghezzi等^[17]研究发现外源和内源FGFs都能诱导VEGF产生, 影响血管形成。

在本文的研究中, 结合TCMSP和DAVID的数据结果分析发现, 木犀草素、熊果酸、槲皮素、山奈酚和芹菜素等在内共92个化合物, 可能通过21个靶点对上述的3条通路有作用。文献报道^[18]熊果酸对人脐静脉血管内皮细胞的增殖具有抑制作用, 而且显著减少MAPK信号通路中ERK1、c-Jun等相关基因的转录和翻译。Chen等^[19]用DR大鼠模型, 研究了槲皮素治疗DR的作用机制, 发现槲皮素可以改善DR大鼠视网膜组织水肿和空泡化, 并且显著降低MMP-9和VEGF的转录和表达。槲皮素也抑制COX-2的表达^[20]。山奈酚抑制IL-1β诱导的MAPK途径, 阻碍MMP1、MMP3和COX-2的表达^[21]。与本文网络药理学预测熊果酸、槲皮素和山奈酚的作用靶点有IL-1β、IL-6、MAPK8等结果一致。文献及网络药理学结果共同提示, 复方血栓通可能具有多种抗炎或抗血管增生机制防治DR。

本文数据分析还发现, 在复方血栓通的化学成分中, 一种化学成分可以对应多个靶点, 参与多个信号通路。如玄参中的熊果酸对应的靶点有IL-1β、MAPK8、JUN和MMP2等, 调控VEGF信号通路、TLR信号通路和局部黏连等。而且, 在DR的发病过程中, 复方血栓通的多个化学成分也可以对应一个共同靶点, 如木犀草素、芹菜素、和熊果酸等共同作用于VEGFA。

总之, 本课题对复方血栓通进行成分和靶点分析, 收集DR的相关基因, 运用网络药理学的方法, 得到二者交集基因的相关通路, 预测复方血栓通通过熊果酸、槲皮素和山奈酚等多个化学成分作用于VEGF、TLR及MAPK等多个信号通路。此研究表明复方血栓通作为中药复方, 其化学成分可能直接作用于DR关键的通路靶点, 通过抑制炎症、血管增生等治疗DR。本研究为进一步深入揭示复方血栓通治疗DR的药理机制奠定了基础。

基金

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国家自然科学基金资助项目(81673705)

参考文献

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文献

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参考文献引证文献

排序方式：

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2018年第53卷第9期

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doi: 10.16438/j.0513-4870.2018-0270

接收时间：2018-03-28
首发时间：2026-01-15
出版时间：2018-09-15

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出版历史

收稿日期：2018-03-28
修回日期：2018-05-01

基金

国家自然科学基金资助项目(81673705)

作者信息

1.北京中医药大学中医学院, 北京 100029

2.北京中医药大学北京中医药研究院, 北京 100029

通讯作者:

* 韩静, Tel:86-10-64286404, E-mail:hanjing8585@163.com

参考文献

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https://castjournals.cast.org.cn/joweb/yxxb/CN/10.16438/j.0513-4870.2018-0270

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2种不同金属材料的力学参数

科 Family	属数 Number of genus	种数 Number of species	占总种数比例 Percentage of total species (%)	属 Genus	种数 Number of species	占总种数比例 Percentage of total species (%)
鹅膏菌科Amanitaceae	2	11	5.26	鹅膏菌属 Amanita	10	4.78
小菇科 Mycenaceae	2	12	5.74	丝盖伞属 Inocybe	5	2.39
多孔菌科 Polyporaceae	8	14	6.70	蜡蘑属 Laccaria	5	2.39
红菇科 Russulaceae	3	23	11.00	小皮伞属 Marasmius	6	2.87
				小菇属 Mycena	11	5.26
				光柄菇属 Pluteus	5	2.39
				红菇属 Russula	17	8.13
				栓菌属 Trametes	5	2.39

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TxT

Pathway	Count	Gene
Salmonella infection	6	MAPK1, IL6, JUN, IL1B, MAPK8, NOS2
VEGF signaling pathway	5	MAPK1, PTGS2, VEGFA, SRC, KDR
Focal adhesion	7	MAPK1, JUN, VEGFA, MET, MAPK8, SRC, KDR
Influenza A	6	MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8, PLG
GnRH signaling pathway	5	MAPK1, JUN, MAPK8, MMP2, SRC
Toll-like receptor signaling pathway	5	MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8
NOD-like receptor signaling pathway	4	MAPK1, IL6, IL-1β, MAPK8
MAPK signaling pathway	6	MAPK1, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8, FGF2
ErbB signaling pathway	4	MAPK1, JUN, MAPK8, SRC
Herpes simplex infection	5	IL6, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8
Cytokine-cytokine receptor interaction	5	IL6, VEGFA, MET, IL-1β, KDR
Arginine and proline metabolism	3	NOS1, ALDH2, NOS2
Regulation of actin cytoskeleton	5	MAPK1, INS, ITGB2, FGF2, SRC
Cell adhesion molecules (CAMs)	4	SELP, ITGB2, SELE
FoxO signaling pathway	4	MAPK1, IL6, INS, MAPK8
Glycerolipid metabolism	3	LPL, AKR1B1, ALDH2
Adherens junction	3	MAPK1, MET, SRC
Progesterone-mediated oocyte maturation	3	MAPK1, INS, MAPK8

Pathway

Count

Gene

Salmonella infection

MAPK1, IL6, JUN, IL1B, MAPK8, NOS2

VEGF signaling pathway

MAPK1, PTGS2, VEGFA, SRC, KDR

Focal adhesion

MAPK1, JUN, VEGFA, MET, MAPK8, SRC, KDR

Influenza A

MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8, PLG

GnRH signaling pathway

MAPK1, JUN, MAPK8, MMP2, SRC

Toll-like receptor signaling pathway

MAPK1, IL6, JUN, IL-1β, MAPK8

NOD-like receptor signaling pathway

MAPK1, IL6, IL-1β, MAPK8

MAPK signaling pathway

MAPK1, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8, FGF2

ErbB signaling pathway

MAPK1, JUN, MAPK8, SRC

Herpes simplex infection

IL6, JUN, TP53, IL-1β, MAPK8

Cytokine-cytokine receptor interaction

IL6, VEGFA, MET, IL-1β, KDR

Arginine and proline metabolism

NOS1, ALDH2, NOS2

Regulation of actin cytoskeleton

MAPK1, INS, ITGB2, FGF2, SRC

Cell adhesion molecules (CAMs)

SELP, ITGB2, SELE

FoxO signaling pathway

MAPK1, IL6, INS, MAPK8

Glycerolipid metabolism

LPL, AKR1B1, ALDH2

Adherens junction

MAPK1, MET, SRC

Progesterone-mediated oocyte maturation

MAPK1, INS, MAPK8

Ligand	COX-2	VEGFR2
The control ligand of COX-2 (tolfenamic acid)	1.504	-
The control ligand of VEGFR2 (C₁₄H₂₃N₅O)	-	3.244
Luteolin (6)	6.765	6.638
Apigenin (8)	6.793	-
Quercetin (98)	6.679	6.374
Kaempferol (422)	6.533	6.256
Ursolic acid (511)	-	7.458

Ligand

COX-2

VEGFR2

The control ligand of COX-2 (tolfenamic acid)

1.504

The control ligand of VEGFR2 (C₁₄H₂₃N₅O)

3.244

Luteolin (6)

6.765

6.638

Apigenin (8)

6.793

Quercetin (98)

6.679

6.374

Kaempferol (422)

6.533

6.256

Ursolic acid (511)

7.458